Ditugaskan pada misi untuk menangkap Mukade, ninja yang hilang, Naruto Uzumaki memutuskan pergi ke reruntuhan bersejarah bernama “Ouran”, di sana dia mengejar dan memojokkan ninja pembunuh. Tujuan Mukades diturunkan menjadi leyline aktif dalam reruntuhan; ia melepaskan kekuatan leyline, menyebabkan cahaya menyelubungi Naruto, mengirimkan dia ke masa lalu, 20 tahun sebelum seri dimulai. Ketika Naruto terbangun, ia datang ke dalam dunia Hokage Keempat, Minato Namikaze.